截至2024年12月底，花溪区共有19个乡镇和街道：青岩镇、石板镇、麦坪镇、燕楼镇、久安乡、孟关苗族布依族乡、湖潮苗族布依族乡、马铃布依族苗族乡、黔陶布依族苗族乡、高坡苗族乡、贵筑街道、阳光街道、清溪街道、溪北街道、金筑街道、平桥街道、小孟街道、黄河路街道、党武街道（2013年12月，花溪区党武镇<2021年3月17日，改为党武街道>和湖潮苗族布依族乡托管到贵安新区，但行政区划仍属于花溪区）。

截至2024年12月，花溪区共计226个村（社区） ，其中：村民委员会153个，社区居民委员会73个。其中：花溪片区138个村（社区），其中：99个村民委员会，39个社区居民委员会；经开片区54个村（社区） ，其中：23个村民委员会，31个社区居民委员会。贵安新区党武街道、湖潮苗族布依族乡共有34个村（社区），其中31个村民委员会，3个社区居民委员会。